MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mannheimia haemolytica D174

Total Repeats: 8418

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021739	ATT	2	6	9	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021739	T	6	6	13	18	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021739	TGG	2	6	3119	3124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021739	ATC	2	6	3141	3146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_021739	TCAAC	2	10	3163	3172	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
6	NC_021739	TCC	2	6	3188	3193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_021739	AG	3	6	3203	3208	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021739	T	6	6	3231	3236	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021739	TAAAT	2	10	3257	3266	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021739	CTTT	2	8	3401	3408	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_021739	CAT	2	6	3418	3423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_021739	CTA	2	6	5456	5461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_021739	T	9	9	5468	5476	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021739	ACA	2	6	5515	5520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_021739	ACC	2	6	5574	5579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_021739	A	6	6	7278	7283	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021739	AGA	2	6	7337	7342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021739	AATC	2	8	7408	7415	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_021739	TTA	2	6	7458	7463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021739	TTA	2	6	7478	7483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021739	AGA	2	6	7492	7497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021739	GACA	2	8	8481	8488	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_021739	TCT	2	6	8527	8532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_021739	TA	3	6	8577	8582	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021739	A	6	6	8646	8651	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021739	TGCC	2	8	8748	8755	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_021739	CAA	2	6	8803	8808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_021739	TTA	2	6	8818	8823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021739	T	6	6	8836	8841	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021739	GAT	2	6	8856	8861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021739	T	6	6	10441	10446	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021739	AG	3	6	10508	10513	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021739	A	7	7	10524	10530	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021739	A	6	6	10567	10572	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021739	T	6	6	10577	10582	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021739	A	6	6	10599	10604	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021739	CGGA	2	8	10662	10669	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_021739	GTA	2	6	10702	10707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021739	CCG	2	6	10760	10765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_021739	CAC	2	6	10801	10806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_021739	TAT	2	6	10844	10849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021739	AAT	2	6	10934	10939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021739	TTA	2	6	10959	10964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021739	ATTA	2	8	10985	10992	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021739	ATTA	2	8	10994	11001	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021739	TTA	2	6	11013	11018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021739	TAT	2	6	11034	11039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021739	A	6	6	11722	11727	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021739	TTA	2	6	11746	11751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021739	AAATT	2	10	16507	16516	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021739	GTT	2	6	16568	16573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021739	CAAATA	2	12	16590	16601	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_021739	ATTTT	2	10	16610	16619	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021739	TAC	2	6	16650	16655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_021739	TAG	2	6	16658	16663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021739	TG	3	6	16670	16675	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021739	TAA	2	6	16689	16694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021739	A	6	6	18448	18453	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021739	ATA	2	6	18491	18496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021739	AGG	2	6	18505	18510	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021739	GTT	2	6	18872	18877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021739	A	7	7	20881	20887	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021739	TTG	2	6	20905	20910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021739	AAT	2	6	23890	23895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021739	A	6	6	26368	26373	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021739	ACT	2	6	26408	26413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_021739	CTAT	2	8	27521	27528	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_021739	TA	3	6	27608	27613	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021739	ATA	2	6	27636	27641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021739	AG	3	6	27674	27679	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021739	TTG	2	6	27694	27699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021739	T	6	6	27711	27716	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021739	CAAA	3	12	27742	27753	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_021739	TTAT	2	8	27770	27777	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021739	GAA	2	6	27801	27806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021739	CT	3	6	30478	30483	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_021739	GA	4	8	30494	30501	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021739	AG	3	6	30533	30538	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021739	TCT	2	6	30605	30610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_021739	TCCC	2	8	30627	30634	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
81	NC_021739	AAG	2	6	30657	30662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021739	CTC	2	6	32593	32598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_021739	A	6	6	32601	32606	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021739	ATT	2	6	32669	32674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021739	TGAT	2	8	32692	32699	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021739	CT	3	6	32702	32707	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_021739	G	7	7	32756	32762	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021739	ATT	2	6	34211	34216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021739	A	6	6	34225	34230	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021739	T	6	6	34252	34257	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021739	ATT	2	6	34276	34281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021739	AAACT	2	10	34286	34295	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_021739	T	8	8	34309	34316	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021739	TGT	2	6	34398	34403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021739	TTAT	2	8	35329	35336	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021739	T	6	6	35356	35361	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021739	AAT	2	6	35394	35399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021739	A	6	6	35427	35432	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021739	ATT	2	6	35485	35490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021739	GTTTT	2	10	36775	36784	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021739	AT	3	6	36787	36792	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021739	ATA	2	6	36854	36859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021739	TGTT	2	8	38368	38375	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021739	TAT	2	6	38385	38390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021739	TC	3	6	38446	38451	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_021739	ATTAA	2	10	38479	38488	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021739	ATTA	2	8	39211	39218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021739	ATA	2	6	39222	39227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021739	TTA	2	6	39275	39280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021739	AATT	2	8	39291	39298	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021739	AGA	2	6	39304	39309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021739	CAAG	2	8	39945	39952	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_021739	T	6	6	39959	39964	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021739	A	7	7	39978	39984	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021739	T	6	6	40023	40028	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021739	CAG	2	6	40032	40037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_021739	AAG	2	6	42032	42037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021739	T	7	7	42079	42085	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021739	CT	3	6	42107	42112	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_021739	T	7	7	42159	42165	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021739	A	6	6	43512	43517	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021739	T	7	7	43537	43543	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021739	TA	3	6	43572	43577	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021739	AG	3	6	43578	43583	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021739	T	6	6	43587	43592	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021739	T	6	6	43627	43632	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021739	TTTC	2	8	43670	43677	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_021739	A	6	6	43688	43693	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021739	TAC	2	6	43719	43724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_021739	AAT	2	6	43748	43753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021739	A	6	6	46208	46213	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021739	GAA	2	6	46889	46894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021739	ATA	2	6	48901	48906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021739	CTT	2	6	48917	48922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_021739	AAATT	2	10	48970	48979	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021739	GTTT	2	8	48998	49005	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021739	TAA	2	6	49006	49011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021739	T	7	7	49012	49018	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021739	A	6	6	49021	49026	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021739	GAA	2	6	49029	49034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021739	T	7	7	49046	49052	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021739	TAT	2	6	49092	49097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021739	AAT	2	6	49133	49138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_021739	T	7	7	49166	49172	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021739	ATAGA	2	10	49176	49185	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_021739	ATT	2	6	49192	49197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021739	AAAT	2	8	51383	51390	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_021739	AAAT	2	8	51403	51410	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_021739	TAT	2	6	51415	51420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_021739	AAC	2	6	54012	54017	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_021739	TAAAT	2	10	54064	54073	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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